Sanitasi merupakan pengendalian semua faktor lingkungan fisik manusia yang dapat menimbulkan akibat buruk terhadap kehidupan manusia, baik fisik maupun mental (WHO). Sarana prasarana sanitasi sekolah/madrasah yang diperlukan anatara lain air bersih yang cukup, jamban sehat, sarana cuci tangan dengan sabun air mengalir, pembuangan limbah cair dan tempatsampah. Sanitasi berkaitan erat dengan pelaksanaan pembiasaan hidup bersih.
- Sarana, Sekolah memiliki sarana sanitasi yang lengkap termasuk jamban terpisah antara laki-laki dan perempuan dengan air bersih yang tersedia sepanjang waktu. Fasilitas cuci tangan dengan air mengalir dan saluran pembuangan air kotor
- Perilaku hidup bersih, cuci tangan pakai sabun secara rutin, buang air di jamban, buang sampah pada tempatnya, minum air yang layak di konsumsi
- Manajemen Sanitasi, manajemen sanitasi berbasis sekolah, biaya operasional sanitasi sekolah dan kegiatan promosi hidup bersih dan sehat dalam RPABS dan mendorong partsipasi masyarakat.
